基因组所-唐中林导师介绍
唐中林
研究员
硕，博士生导师
男
基因组所
生物化学与分子生物学
,畜牧
动物遗传育种与繁殖
tangzhonglin@caas.cn
博士招生专业
1
生物化学与分子生物学
2019
1
学术型博士
动物分子生物学与基因工程
2
生物化学与分子生物学
2020
1
学术型博士
动物分子生物学与基因工程
招生信息
1
生物化学与分子生物学
2022
1
学术型硕士
动物分子生物学与基因工程
2
畜牧
2022
1
专业学位硕士
动物繁育原理与技术
3
畜牧
2020
1
专业学位硕士
动物繁育原理与技术
唐中林，博士，研究员，博士生导师。中国农业科学院“猪基因组设计育种创新团队”首席科学家，中国农业科学院佛山鲲鹏现代农业研究院执行院长。2006-2017年在中国农业科学院北京畜牧兽医研究所任副研究员、研究员，2015-2016年在哈佛大学医学院做访问学者，2018年12月-2021年5月受聘为中国农业科学院深圳农业基因组研究所动物基因组研究中心主任。
2014年入选科技部“创新人才推进计划”领军人才，2016年入选国家重大人才工程科技创新领军人才。目前兼任国际PAG-Asia会议共同主席、中国畜牧兽医学会动物遗传育种分会理事、中国畜牧兽医学会养猪分会理事、中国畜牧兽医学会畜禽遗传标记分会常务理事和中国实验动物学会第一届无菌动物专业委员会常务委员、全国生猪遗传改良计划专家委员会委员（2021-2035）、第三次全国畜禽遗传资源普查技术专家组成员、“农业部猪肉质量安全控制重点实验室”学术委员会副主任、“广西壮族自治区巴马香猪资源开发工程研究中心”主任、“广西家畜遗传改良重点实验室”学术委员会副主任，《Frontiers in bioscience》、《Genes》、《Animals》等多种国际刊物和《中国实验动物学报》编委，《中国比较医学杂志》通讯编委。此外，受聘为华中农业大学、华南农业大学、广西大学、河南大学等国内多个高校的兼职教授，荷兰瓦赫宁根大学、新西兰都柏林大学和澳大利亚默多克大学等多个国外大学的博士生联合导师。主持国家自然科学基金重点及面上项目、973子课题、863重点和转基因重大专项子课题、广东省重点研发项目、广东省粤深联合基金重点项目、中国农科院重大科研任务等国家及省部级项目近20项；发表科研论文143篇（其中SCI论文70篇），其中以第一作者或通讯作者（含共同）在Genome Biology、Nucleic Acid Research、JBC和DNA Research等国际知名刊物发表SCI论文40余篇，论文被SCI引用1037次，受国外学者邀请参编专著3本。作为主要完成人获国家技术发明二等奖、中国发明专利银奖、中国专利优秀奖、广西科技进步二等和三等奖、中华农业科技奖优秀创新团队奖等国家和省部级奖7项，中国科协优秀论文特等奖1项，获国际发明专利1项，国家发明专利18项，软件著作权23项，实用新型专利1项，作为主要完成人培育猪新品种和配套系3个。
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科研项目
项目名称 | 项目编号 | 经费总额（万元） |
良猪计划 | AGIS-ZDKY202003 | 2500 |
猪高效抗病生物学基础与基因组设计育种 | CAAS-ZDRW202006 | 1350 |
染色质可及性通过影响骨骼肌细胞组分调控猪肉品质的分子机制 | 2019B1515120059 | 100 |
Hippo/Wnt通路交互作用及三维调控影响猪瘦肉量性状形成的分子机制 | 31830090 | 289 |
新一代瘦肉型种猪育种技术研究与品种（品系）创建 | 2018B020203002 | 20 |
地方猪育种技术体系研发与新品系创建 | 2018B020203003 | 18 |
重20180322遗传修饰抗病育种猪的创建与新品系品种培育技术研发 | JSGG20180507182028625 | 112.5 |
重20180322遗传修饰抗病育种猪的创建与新品系品种培育技术研发 | PT202101-06 | 10.6 |
新一代瘦肉型种猪育种技术研究与品种（品系）创建 | PT202101-07 | 4.0 |
地方猪育种技术体系研发与新品系创建 | PT202101-08 | 3.6 |
Hippo/Wnt通路交互作用及三维调控影响猪瘦肉量性状形成的分子机制 | PT202101-16 | 21.6 |
Hippo/Wnt通路交互作用及三维调控影响猪瘦肉量性状形成的分子机制 | PT202001-04 | 36.1 |
转基因生物新品种培育重大专项子课题-优质环保转基因猪新品种培育（2016） | 2016ZX08006002-005 | 265.75 |
转基因生物新品种培育重大专项子课题-动物重要基因克隆及功能验证（2016） | 2016ZX08009003-006 | 228.5 |
环状RNA2196对猪骨骼肌糖代谢及产物性状的调控机制（2017） | JCYJ20170307160516413 | 50 |
猪基因组育种SNP芯片开发及其应用（2018） | KY20180114 | 40 |
环状RNA2196对猪骨骼肌糖代谢及产物性状的调控机制（2017） | PT20170305 | 25 |
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研究成果
1.Adeyinka A. Adetula, Xinhao Fan, Yongsheng Zhang, Yilong Yao, Junyu Yan, Muya Chen, Yijie Tang, Yuwen Liu, Guoqiang Yi, Kui Li & Zhonglin Tang (2021) Landscape of tissue-specific RNA Editome provides insight into co-regulated and altered gene expression in pigs (Sus-scrofa), RNA Biology, DOI: 10.1080/15476286.2021.1954380
2.Yan J, Yang Y, Fan X, Tang Y, Tang Z*. Sp1-Mediated circRNA circHipk2 Regulates Myogenesis by Targeting Ribosomal Protein Rpl7. Genes (Basel). 2021 May 8;12(5):696. doi: 10.3390/genes12050696.
3.Yalan Yang#, Xinhao Fan#, Junyu Yan#, Muya Chen, Min Zhu, Yijie Tang, Siyuan Liu, Zhonglin Tang*. A comprehensive epigenome atlas reveals DNA methylation regulating skeletal muscle development. Nucleic Acids Research. 2020, 49(3):1313-1329
4.Zhou, C.*, Sun, Y.*, Yan, R.*, Liu, Y.*, Zuo, E.*, Gu, C., Han, L., Wei, Y., Hu, X., Zeng, R., Li, Y.#, Zhou, H.#, Guo, F.#, Yang, H.# .(2019).Off-target RNA mutation induced by DNA base editing and its elimination by mutagenesis. Nature:571, 275–278
5.Zuo, E.*, Sun, Y.*, Wei, W.*, Yuan, T.*, Ying, W., Sun, H., Yuan, L., Steinmetz, L. M.#, Li, Y.#, Yang, H#.(2019). Cytosine base editor generates substantial off-target single-nucleotide variants in mouse embryos. Science :364, 289-292.
6.Xinxin Zhang#, Yilong Yao#, Jinghua Han, Yalan Yang, Yun Chen, ZhongLin Tang*, Fei Gao*, Longitudinal epitranscriptome profiling reveals the crucial role of N6-methyladenosine methylation in porcine prenatal skeletal muscle development. Journal of Genetics and Genomics. 2020, 47 (8): 465-476.
7.YongSheng Zhang, YiLong Yao, ZiShuai Wang, Dan Lu, YuanYuan Zhang, Adeyinka Abiola Adetula, SiYuan Liu, Min Zhu, YaLan Yang, XinHao Fan, MuYa Chen, YiJie Tang, Yun Chen, YuWen Liu, GuoQiang Yi, ZhongLin Tang*. MiR-743a-5p regulates differentiation of myoblast by targeting Mob1b in skeletal muscle development and regeneration. Genes & Diseases. 2020, https://doi.org/10.1016/j.gendis.2020.11.018.
8.Guoming Liang, Junyu Yan, Jin Guo, Zhonglin Tang*. Identification of Ovarian Circular RNAs and Differential Expression Analysis between MeiShan and Large White Pigs. Animals. 2020, 10(7):1114.
9.Zhang yongsheng, Lu dan, Liu Yuwen, Yi guoqiang, Tang zhonglin*. The untold story between enhancers and skeletal muscle development. Journal of Integrative Agriculture. 2020, 19(0):2-14.
10.Zishuai Wang, YalanYang, Shuaicheng Li, Kui Li, Zhonglin Tang*. Analysis and Comparison of Long Non-coding RNAs Expressed in the Ovaries of Meishan and Yorkshire pigs. Animal Genetics. 2019, 50(6):660-669.
11.Muya Chen, Yi Long Yao, Yalan Yang, Min Zhu, Yijie Tang, Siyuan Liu, Kui Li and Zhonglin Tang*. Comprehensive Profiles of mRNAs and miRNAs Reveal Molecular Characteristics of Multiple Organ Physiologies and Development in Pigs. Frontiers in Genetics. 2019,10:756.
12.Zishuai Wang, Xikang Feng, Zhonglin Tang*, Shuai Cheng Li *. Genome-Wide Investigation and Functional Analysis of Sus scrofa RNA Editing Sites across Eleven Tissues. Genes (Basel). 2019,30;10(5).
13. Yalan Yang, Min Zhu, Xinhao Fan, Yilong Yao, Junyu Yan,Yijie Tang, Siyuan Liu, Kui Li* and Zhonglin Tang*. Developmental atlas of the RNA editome in Sus scrofa skeletal muscle. DNA Research. 2019, 26(3):261-272.
14. Xiaofei Yu, Zishuai Wang, Hao Sun, Guanglin Niu, Kui Li and Zhonglin Tang*. Long non‐coding MEG3 is a marker for skeletal muscle development and meat production traits in pigs. Animal Genetics. 2018, 49(6):571-578.
15. Guoming Liang, Yalan Yang, Hua Li, Hui Yu, Xunbi Li, Zhonglin Tang* and Kui Li*. LncRNAnet: a comprehensive sus scrofa lncRNA database. Animal Genetics. 2018,49(6):632-635.
16. Guoming Liang, Yalan Yang, Guanglin Niu, Zhonglin Tang*, and Kui Li*. Genome-wide profiling of Sus scrofa circular RNAs across 9 organs and 3 developmental stages, DNA Research. 2017, 24(5):523-535.
17. Zhonglin Tang*, Yang Wu*, Yalan Yang*, Yu-Cheng T. Yang, Zishuai Wang, Jiapei Yuan,Yang Yang, Chaoju Hua, Xinhao Fan, Guanglin Niu, Yubo Zhang, Zhi John Lu & Kui Li. Comprehensive analysis of long non-coding RNAs highlights their spatio-temporal expression patterns and evolutional conservation in Sus scrofa. Scientific Reports. 2017,7, 43166.
18. Yalan Yang, Guoming Liang, Guanglin Niu, Yuanyuan Zhang, Rong Zhou, Yanfang Wang, Yulian Mu, Zhonglin Tang*, Kui Li*. Comparative analysis of DNA methylome and transcriptome of skeletal muscle in lean-, obese-, and mini-type pigs. Scientific Reports. 2017, 7:39883.
19. Guanglin Niu#, Yalan Yang#, YuanYuan Zhang, Chaoju Hua, Zishuai Wang, Zhonglin Tang*, Kui Li. Identifying suitable reference genes for gene expression analysis in developing skeletal muscle in pigs. Peer J. 2016, 4: e2428
20. Yalan Yang, Rong Zhou, Yulian Mu,Xinhua Hou, Zhonglin Tang*, Kui Li. Genome-wide analysis of DNA methylation in obese, lean, and miniature pig breeds. Scientific Reports. 2016;7: 30160.
21. Yalan Yang#, Zhonglin Tang#, Xinhao Fan, Kui Xu, Yulian Mu, Rong Zhou*, Kui Li*. Transcriptome analysis revealed chimeric RNAs, single nucleotide polymorphisms and allele-specific expression in porcine prenatal skeletal muscle. Scientific Reports. 2016; 6:29039.
22. Chaoju Hua#, Zishuai Wang#, Jianbing Zhang, Xing Peng, Xinhua Hou, Yalan Yang, Kui Li, Zhonglin Tang*. SMAD7, antagonist of TGF-beta signaling, is a candidate of prenatal skeletal muscle development and weaning weight in pigs, Molecular Biology Reports. 2016 ,43(4):241-51.
23. Xinhua Hou#, Yalan Yang#, Shiyun Zhu, Chaoju Hua, Rong Zhou, Yulian Mu, Zhonglin Tang*, Kui Li. Comparison of skeletal muscle miRNA and mRNA profiles among three pig breeds. Molecular Genetics and Genomics. 2016,291(2):559-73.
24. Zhang L, Huang Y, Wang M, Guo Y, Liang J, Yang X, Qi W, Wu Y, Si J, Zhu S, Li Z, Li R, Shi C, Wang S, Zhang Q, Tang Zhonglin, Wang L, Li K, Fei JF, Lan G*. Development and Genome Sequencing of a Laboratory-Inbred Miniature Pig Facilitates Study of Human Diabetic Disease. iScience. 2019 Jul 20;19:162-176.
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学校介绍
中国农业科学院研究生院成立于1979年，1981年经国务院批准开始实施硕士、博士学历学位教育，是我国国家级科研机构举办研究生教育的先行院所之一。作为支撑我院研究生教育的中国农业科学院成立于1957年，是农业农村部直属的综合性国家农业科研机构，是全国综合性农业科学研究的最高学术机构，是农业及农业科学技术战略咨询机构，是三农领域国家战略科技力量，担负着全国农业重大基础与应用基础研究、应用研究和高新技术技术研究的任务，致力于解决我国农业及农村经济发展中公益性、基础性、全局性、战略性、前瞻性的重大科学与技术问题。在推动农业科技创新、服务经济社会发展、培养高层次人才、促进国际交流与合作等方面发挥着重要作用。“十三五”期间，共获得国家科学技术奖36项，占全国农业领域获奖总数的26%。其中科技进步一等奖1项，自然科学二等奖2项，技术发明二等奖6项，科技进步二等奖27项；获得省部级奖励229项；发表论文近30000篇，其中SCI论文近15000篇、《NATURE》《SCIENCE》《CELL》等国际顶级学术期刊论文29篇；出版专著近1500部，通过国审品种等近1200个，获得植物新品种权397项，新兽药证书55个等。科研成果与科研实力处于行业领先地位。
中国农科院研究生教育依托中国农业科学院的国家级科研平台基地、先进科研设施设备、重大科研攻关项目、稳定的科研经费保障、前沿交叉学科集群、一流的导师队伍、广泛的国际合作机制、丰富的图书文献等各种重要资源，形成了38个研究所共同参与、“院所结合、两段式培养”这一特色鲜明的科研机构举办研究生教育的创新模式，将中国农业科学院的科研资源优势转化为学科建设、人才培养、特色办学优势，为研究生完成课程教学、开展学术研究、参与课题实践、培养创新能力提供了农业科研国家队特有的广阔舞台。
中国农业科学院深圳农业基因组研究所（以下简称“基因组所”），创建于2014年，是农业农村部，中国农科院和深圳市在科技体制改革的背景下，整合农业基因组学研究力量在深圳成立的新型研究所。
成立以来，基因组所深入贯彻落实习近平总书记“四个面向、两个一流”指示精神，开展科研自主权改革试点工作，被列为中国农科院现代院所改革的“试验田”，建设了由中国农科院与深圳市主管领导任共同理事长的理事会；组建了近800人的研究队伍；形成了以组学技术为核心、辐射农业、食品和生态方向的学科体系，获批“岭南现代农业科学与技术广东省实验室深圳分中心”“农业农村部农业基因数据分析重点实验室”等创新载体；在包括 Science、Nature、Cell 等顶级期刊在内的杂志上发表SCI论文400多篇，以基因组设计育种育成国审、省审新品种30余个，农业基因组学等研究领域占据世界前沿。 2019年、2020年连续两年自然指数排名全国农业类科研院所第一名，多项成果入选“‘十三五’农业科技十大标志性成果”“中国生命科学十大进展”“中国农业科学十大进展”。先后获得“何梁何利基金”奖、“周光召基础科学奖”“深圳经济特区建立40周年创新创业和先进模范人物”“深圳市市长奖”等奖励。基因组所联合深圳市相关部门提出了“深圳国际食品谷”，规划已得到市政府印发，将构建农业食品产学研协作生态，做出科技推动农业食品产业转型升级的先行示范。
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按照国家相关规定，我院全日制与非全日制硕士研究生学费标准均为：10000元/人/年。凡我院各研究所录取的推免生均免收第一年学费，优秀推免生免收基本学制内全部学费。
我院全日制非定向硕士研究生奖助学金体系由奖学金和助学金两部分组成。奖学金包括国家奖学金、学业奖学金（100%覆盖）、研究生院单项奖学金和企业奖学金。助学金包括国家助学金、研究生院助学金、导师助研津贴、“三助”津贴和特困生补助，具体奖助学金政策可登陆中国农业科学院研究生院网站查询。
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